Si tratta del primo sistema third generation sequencing arrivato sul mercato. Questa piattaforma, lanciata da Helicos Biosciences, consente il sequenziamento di molecole originali di DNA/RNA senza step di manipolazione delle molecole. Le molecole di RNA possono essere sequenziat direttamente, anche senza essere preventivamente retrotrascritte in cDNA. La metodica è basata sul principio del sequencing-by-synthesis. Il sistema è in grado di funzionare con bassissime quantità di DNA/RNA (400-1000 attomoli), non produce errori nelle zone ricche in CG ed è efficace anche su campioni estratti da paraffina. Il sistema tuttavia presenta alcune limitazioni, principalmente legate alla lunghezza ridotta delle reads (fino a 55 nucleotidi solamente) e al tasso di errore pari al 3-4%, che ne hanno limitato il successo commerciale.
Nessun commento:
Posta un commento