PROVEAN (PROtein Variation Effect ANalyzer) è un software per l'analisi in silico di mutazioni missenso (o mutazioni indel che inducano una sostituzione aminoacidica). Lo scopo di PROVEAN è quello di calcolare il possibile impatto della mutazione sulla funzionalità della proteina. PROVEAN è ospitato, insieme a SIFT, sul sito del J Craig Venter Institute, dove si dichiara che la funzionalità del software è sovrapponibile a quella di altri programmi simili come Polyphen2. Sul sito è disponibile anche una variante denominata PROVEAN HUMAN GENOME VARIANTS, che consente di fare l'analisi delle varianti tramite PROVEAN e SIFT in contemporanea.
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