venerdì 20 settembre 2013

SOTTOTIPI GENETICI DI ATASSIA SPINOCEREBELLARE


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L'atassia spinocerebellare è una delle malattie genetiche più eterogenee che si conoscano. La malattia può infatti essere estremamente variabile dal punto di vista clinico e, similmente, può riconoscere diverse cause genetiche e diversi tipi di ereditarietà. Qui sotto riportiamo una lista aggiornata dei vari sottotipi, dividendoli in tre gruppi principali in base al tipo di ereditarietà e fornendo per ciascuno sottotipo la localizzazione cromosomica, il gene nel quale sono state individuate le mutazioni (se noto) e il/i test di laboratorio più indicati per la diagnosi. è bene sottolineare che, data la grande sovrapposizione di sintomi e segni clinici di molti sottotipi, può essere consigliato in molti casi procedere all'analisi non di un gene per volta, ma all'analisi di un pannello di più geni in parallelo. Per ulteriori dettagli sulle metodiche di laboratorio si può leggere qui. Per informazioni generali sull'atassia spinocerebellare si può invece leggere qui.

Tabella 1 – ATASSIA SPINOCEREBELLARE AUTOSOMICA DOMINANTE
Sottotipo
Localizzazione cromosomica
Gene
Spettro mutazionale
Analisi indicata
FLA/RPA
Seq
Del/dup
SCA1
6p22.3
ATXN1
RE
x


SCA2
12q24.12
ATXN2
RE
x


SCA3
14q24.3-q31
ATXN3
RE
x


SCA4
16q22.1
scon.
scon.



SCA5
11q13.2
SPTBN2
P

x

SCA6
19p13.2
CACNA1A
RE, P
x
x

SCA7
3p14.1
ATXN7
RE
x


SCA8
13q21
ATXN8OS
RE
x


SCA9
scon.
scon.
scon.



SCA10
22q13.31
ATXN10
RE
x


SCA11
15q15.2
TTBK2
P

x

SCA12
5q32
PPP2R2B
RE
x


SCA13
19q13.33
KCNC3
P

x

SCA14
19q13.42
PRKCG
P

x

SCA15
3p26.1
ITPR1
D, P

x
x
SCA16
see SCA15




SCA17
6q27
TBP
RE
x


SCA18
7q22-q32
scon.
scon.



SCA19
1p21-q21
scon.
scon.



SCA20
11q21
scon.
D


x
SCA21
7p21.3-p15.1
scon.
scon.



SCA22
see SCA19




SCA23
20p13
PDYN
P

x

SCA24
see SCAR4




SCA25
2p21-p13
scon.
scon.



SCA26
19p13.3
scon.
scon.



SCA27
13q33.1
FGF14
P

x

SCA28
18p11.21
AFG3L2
P

x

SCA29
3p26.1
ITPR1
D, P

x
x
SCA30
4q34.3-q35.1
scon.
scon.



SCA31
16q21
BEAN1
I



SCA32
7q32-q33
scon.
scon.



SCA33
not classified




SCA34
6p12.3-q16.2
scon.
scon.



SCA35
20p13
TGM6
P

x

SCA36
20p13
NOP56
RE
x



Legenda: RE: repeat expansion (espansione di ripetizione); P: mutazioni puntiformi o piccole delezioni/inserzioni/duplicazioni; D: grandi delezioni o duplicazioni; I: grandi inserzioni; FLA/RPA: fragment length analysis/repeat primed assay; Seq: sequenziamento; Del/dup: analisi di delezione/duplicazione (MLPA/qPCR); scon.: sconosciuto/a.

Table 2 – ATASSIA SPINOCEREBELLARE AUTOSOMICA RECESSIVA
Subtype
Chromsomal Location
Gene
Mutational spectrum
Required analysis
FLA/RPA
Seq
Del/dup
SCAR1
9q34.13
SETX
P, D

x
x
SCAR2
9q34-qter
scon.




SCAR3
6p23-p21
scon.




SCAR4
1p36
scon.




SCAR5
15q25.3
ZNF592
P

x

SCAR6
20q11-q13
scon.




SCAR7
11p15 
scon.




SCAR8
6q25.1-q25.2
SYNE1
P

x

SCAR9
1q42.13
ADCK3
P

x

SCAR10
3p22.1
ANO10
P

x

SCAR11
1q32.2
SYT14
P

x

SCAR12
16q21-q23
scon.

x


SCAR13
6q24.3
GRM1
P

x

SCAR14
11q13.2
SPTBN2


x

FRDA
9q21.11
FXN
RE, P, D
x
x
x
VED
8q12.3
TTPA
P, D

x
x
SCAE
15q26.1
POLG
P, D

x
x
SCAN1
14q32.11
TDP1
P

x

SCAN2
see SCAR1




CAHH
7p22.1
RNF216
P

x

EAOH
9p21.1
APTX
P, D

x
x
IOSCA
10q24.31
C10orf2
P

x

SACS
13q12.12
SACS
P, D

x
x

Legenda: RE: repeat expansion (espansione di ripetizione); P: mutazioni puntiformi o piccole delezioni/inserzioni/duplicazioni; D: grandi delezioni o duplicazioni; I: grandi inserzioni; FLA/RPA: fragment length analysis/repeat primed assay; Seq: sequenziamento; Del/dup: analisi di delezione/duplicazione (MLPA/qPCR); scon.: sconosciuto/a.
 
Table 3 – ATASSIA SPINOCEREBELLARE X-LINKED
Subtype
Chromsomal Location
Gene
Mutational spectrum
Required analysis
FLA/RPA
Seq
Del/dup
SCAX1
Xp11.21-q21.3
ATP2B3
P

x

SCAX2
scon.
scon.




SCAX3
scon.
scon.




SCAX4
scon.
scon.




SCAX5
Xq25-q27.1
scon.




ASAT
Xq13.3
ABCB7
P

x

FXTAS
Xq27.3
FMR1
RE
x



Legenda: RE: repeat expansion (espansione di ripetizione); P: mutazioni puntiformi o piccole delezioni/inserzioni/duplicazioni; scon.: sconosciuto/a.

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