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giovedì 23 gennaio 2014

shRNA: PICCOLI RNA A FORCINA

shRNA: short hairpin RNAshRNA è acronimo per short hairpin RNA, che letteralmente significa piccoli RNA a forcina. Si tratta di piccoli RNA la cui sintesi cellulare viene indotta previa transfezione con plasmidi o con vettori batterici o virali. Lo scopo degli shRNA è quello di mediare un processo di RNA interference (RNAi), che può essere utilizzato per finalità di ricerca.

mercoledì 22 gennaio 2014

piRNA: PIWI-INTERACTING RNA

piRNA: PIWI-interacting RNA
piRNA è acronimo per PIWI-interacting RNA. Si tratta di piccole molecole di RNA della lunghezza di circa 29-30 nucleotidi che mostrano una biogenesi diversa da quella degli mRNA, dei siRNA di altri tipi di RNA. Fino ad ora i piRNA sono stati indentificati solo nelle cellule germinali degli animali, dove svolgono una funzione di silenziamento genico (gene-silencing). Per questo motivo per i piRNA è stato introdotto il concetto di modificatori epigenetici transgenerazionali.

Per saperne di più: PIWI-interacting RNAs: from generation to transgenerational epigenetics (PubMed).

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martedì 21 gennaio 2014

snRNA: PICCOLI RNA NUCLEARI IMPORTANTI NELLO SPLICING

snRNA: operatori nello splicing
snRNA è acronimo per small nuclear RNA. Si tratta di piccole molecole di RNA nucleare, tendenzialmente ricche in uridina, e perciò identificate dalle sigle U1, U2, U3 ecc. Gli snRNA hanno una funzione fondamentale nel processo di splicing. I cosiddetti RNA spliceosomiali sono infatti snRNA.

snoRNA: MODIFICATORI DEL NUCLEOLO

snoRNA: modificatori
snoRNA è acronimo per small nucleolar RNA. Gli snoRNA sono delle piccole molecole di RNA la cui funzione si espleta nel cuore più profondo della cellula: il nucleolo. La loro funzione è sostanzialmente quella di essere dei modificatori. Gli snoRNA possono infatti modificare gli rRNA (RNA ribosomiale), inducendo fenomeni di metilazione e pseudouridilazione in siti specifici, e anche alcuni snRNA (small nuclear RNA).

asRNA: RNA ANTISENSO, UNA VOLTA PROMESSA DELLA TERAPIA GENICA

RNA antisenso - terapia genica
asRNA sta per RNA antisenso. Si tratta di molecole di RNA di medie-grandi dimensioni, che sono complementari a molecole di mRNA. TSIX, ad esempio, un asRNA che regola la trascrizione del gene XIST.

lcnRNA: LONG NON-CODING RNA



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Esistono RNA non codificanti? A cosa servono? Quanti tipi se ne conoscono?

long non coding RNA
lncRNA è acronimo di long non coding RNA. I lncRNA, come i microRNA, i siRNA, gli aRNA, i piwiRNA ed altri, fanno parte del gruppo degli RNA non codificanti (ncRNA), la cui crucialità in vari processi biologici è ormai data per scontata, anche se in molti casi i meccanismi di azione rimangono oscuri.

mercoledì 15 gennaio 2014

siRNA: SMALL INTERFERING RNA

Cosa sono i siRNA? Cosa è il processo di RNA intereference?

siRNA sta per small interefering RNA. Si tratta di piccole molecole di RNA, la cui funzione è quella di impedire l'espressione genica o proteica. I siRNA reprimono l'espressione di un gene legandosi al messaggero (mRNA) e inducendone la degradazione. Questo meccanismo è detto di RNA interefence (RNAi) - anche se è bene ricordare che quello mediato dai siRNA non è l'unico tipo di RNAi. L'RNAi è forse una della maggiori promesse nel campo della terapia genica. L'idea è quella di bloccare l'espressione dei geni mutati (cioè danneggiati), allo scopo di prevenire la sintesi della proteina dannosa.

giovedì 9 gennaio 2014

microRNA: PICCOLI MA TOSTI!

microRNA: maturazione e funzione
È possibile che i microRNA svolgano un ruolo primario nella genesi delle malattie genetiche?

I microRNA (miRNA) cosituiscono un sottotipo molto numeroso di RNA non codificante (ne esistono vari altri sottotipi: aRNA, lincRNA, piRNA, siRNA, snRNA e molti altri ancora. Per un trattazione generale potete leggere RNA DI TUTTI I TIPI: I VERI PILOTI DELLA CELLULA).

mercoledì 8 gennaio 2014

RNA NON CODIFICANTI (ncRNA): I PILOTI DELLA CELLULA

Dopo anni in cui il DNA l'ha fatta da protagonista, ora è giunto il momento degli RNA!

Beh, non si può certo biasimare la comunità scientifica per aver infuso tanto entusiasmo in tutto ciò che ha a che fare col DNA. Del resto il completamento del Progetto Genoma Umano (che ha portato al sequenziamento dell'intero genoma) è cosa di pochi anni fa. Oggi, tuttavia, sempre più medici e biologi si stanno rendendo conto che potrebbe essere lo studio di un'altra molecola, l'RNA, a costituire la chiave di svolta per colmare il gap di conoscenza che ancora ci separa dalla comprensione di molti aspetti del genoma e forse dalla terapia di molte malattie genetiche.