La conferma finale che una mutazione è davvero una mutazione driver arriva soltanto dopo l'esecuzione di studi funzionali in vitro, cioè su vere cellule, dai quali ci si aspettano evidenze che tale mutazione possa significativamente influenzare la capacità di crescita e proliferazione cellulare, il processo di de-differenziazione cellulare, ecc. Prima degli studi in vitro si cercano di solito altre indizi tramite l'analisi in silico, ossia tramite predizioni computerizzate sugli aspetti funzionali della mutazione. Tuttavia, come detto, la conferma finale si può avere solo dopo studi funzionali in vitro.
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